O diagnóstico da PWS baseia-se em critérios clínicos e o diagnóstico definitivo pode ser confirmado através da análise genética.

Em 1993, Holm e cols. propuseram critérios clínicos maiores e menores para diagnóstico. Assim: 5 pontos, sendo 4 de critérios maiores em pacientes menores de 3 anos; 8 pontos, sendo 6 de critérios maiores em pacientes com mais de 3 anos de idade.

1- critérios maiores ( 1 ponto)

• hipotonia neonatal
• dificuldade de alimentação na infância ou retardo do desenvolvimento neuro-psico motor
• ganho excessivo de peso a partir de 1 ano e 6 meses
• hipogonadismo
• retardo mental, problemas de apredizado
• hiperfagia, obsessão por comida
• características faciais (olhos amendoados, lábio superior pouco espesso)
• deleção do locus 15q11-q13 em análise citogenética

2- critérios menores ( 0,5 ponto)

• diminuição dos movimentos fetais
• problema de comportamento ( 5destes: fúria, acessos de violência, obsessivo-compulsivo, argumentativo, rígido, possessivo, teimoso, mentiroso, cleptomania)
• apneia do sono
• baixa estatura
• cabelos, olhos e pele mais claros
• mãos e pés pequenos
• mãos estreitas
• miopia
• saliva viscosa
• defeito na articulação de palavras
• lesões de pele ( auto-agressão)

Gunay-Aygun e cols., em 2001 propuseram uma nova abordagem destes critérios, com a divisão de acordo com a faixa etária em que podem se manifestar. Sendo que a análise genética está indicada caso os pacientes com suspeita diagnóstica de PWS apresentem todos os critérios correspondentes a sua faixa etária.

idade                   critérios

• 0 a 2 anos        hipotonia com má sucção
• 2 a 6 anos        hipotonia com má sucção, atraso global do desenvolvimento
• 6 a 12 anos        história de hipotonia com má sucção, atraso global do desenvolvimento, excessiva ingesta alimentar
• maiores de 12 anos       funções cognitivas prejudicadas, geralmente retardo mental moderado; excessiva ingesta alimentar, hipogonadismo hipogonadotrófico e/ou problemas comportamentais típicos (incluindo transtorno obsessivo-compulsivo e temperamento tântrico